目前报检中心有12人，一般有8个窗口对外服务。分别是负责出入境货物的报检，签发通关单和接受业务咨询。入境货物的报检业务（目前出境业务还未全面展开）中包括了单证审核、计费、木质包装抽查、电子转单、凭证核销、物理报检单证的登记流转。负责签发通关单的窗口将对经检验检疫合格且已计收费的出境货物报检批签发出境货物通关单，对已计收费的入境货物报检批签发入境货物通关单。

主要工作职责：
一、负责洋山保税港区出入境货物和集装箱的电子审单工作，负责对《洋山深水港检验检疫电子审单查验系统》等电子业务系统进行日常维护；
二、负责就“检港联动”的业务模式和相应的电子信息系统的运行情况与相关单位进行工作协调；
三、配合洋山检验检疫业务系统的开发、优化和运行；
四、负责受理洋山保税港区出入境货物的报检，并承担计费和签发出入境货物通关单工作；
五、负责洋山局各类出入境货物检验检疫证书、证单的缮制、审核和签发工作；
六、负责洋山局出入境检验检疫业务档案的归档和管理；
七、负责对洋山局出入境检验检疫空白证书、证单以及业务印鉴的管理；
八、负责办理洋山保税港区的委托检验检疫业务工作；
九、负责受理有关洋山局检验检疫业务的咨询；