1.入境植物及植物产品。
    2.入境动物及动物产品，又可分为对食用类动物产品与非食用类动物产品的检验检疫两大类。食用类动物产品主要有：进口肉类、水产品、乳产品等。非食用类动物产品主要有预处理牛皮、羊皮等。
    3.入境的化、矿、金产品。包括塑料、金属材料、化工品、橡胶、纸张等。
    4.入境预包装食品和化妆品，也包括食品和化妆品的原料
    5.入境废物原料的检验检疫，包括废纸、废塑料、废钢材、 废五金等十余种废物原料。
    6.入境纺织品及其原料

    此外查验二科也对上述商品的木质包装进行检验检疫，需要做放射性检测的商品，也可在芦潮查验场地进行放射性检测。对发现有夹带动植物疫情的集装箱实施相应的检疫处理，包括药剂喷洒或熏蒸处理等。